吉林农业大学药学一级学科硕士授权点设立于2010年，授予医学硕士学位，其二级学科有生药学、药理学，在发展过程中形成了学科特色和优势，拓展了部分药学研究领域。

 生药学二级学科于2005年获得硕士学位授予权，2007年开始招生。下设植物生药学、菌物生药学和动物生药学3个研究方向，通过开展生药资源的分布与蕴藏量、规范化种植与养殖、采收加工、化学成分、药理活性、质量评价、资源开发与利用等方面的科学研究，确保生药及其产品的安全、有效和质量可控，发现生药新资源及药效物质基础，推动生药资源的可持续开发与利用，服务医疗健康事业。

 药理学二级学科于2012年开始招生。该学科侧重药物的功效评价及其作用机理的研究，下设天然药物药理学一个方向。

 药学一级学科有24名研究生导师，其中院士1人，外籍院士2人，博士生指导教师12人，具高级职称者18人，中青年约占90%，100%具有博士学位，是一支职称、年龄、知识结构合理，具有雄厚科研潜能和创新能力的学术团队。承担国家、省（部）级科研项目50余项，获国家科技进步二等奖 1项，省科技进步一等奖2项、二等奖1项、三等奖1项。发表论文300余篇（SCI 40余篇），学术著作15部，获授权国家发明专利20余项。